血浆中的外泌体。
HIV病毒进入T细胞。
成熟病毒粒子中的衣壳组装。
2 软件特点
- 科学性
- 借助VR设备可实现3D立体效果
3 软件使用简介
软件界面
按照绘制主题,分为HIV病毒、T细胞表面和血浆三个元件集合区。鼠标放在上面,可展示每个元件的说明。
以绘制HIV病毒为例,作者还做了一份PDF说明。
点击右下角的温度计至红色区域,病毒粒子中的小分子就开始模拟布朗运动魔性跳舞,温度越高,跳的越快。
绘制过程中,有几个注意事项:
1 逆时针方向绘制核衣壳和包膜,以便让软件分辨膜内和膜外区域,后期正确插入膜蛋白。
2 先后顺序。先画RNA,然后点击链上任意位置即可等距离添加核衣壳蛋白。
cellPAINT由美国Scripps研究所的Adam Gardner, Ludovic Autin, Arthur Olson和David Goodsell负责开发, 还得到了NIH的资助。其中David Goodsell是一位结构生物学家,也是大名鼎鼎的科学画师,为许多顶级科技期刊画过封面。
David Goodsell笔下高级莫兰迪配色的HIV病毒、埃博拉病毒以及寨卡病毒(从左到右,来源Science)
David Goodsell大神本尊和一些以他的画作为封面的期刊(来源Science)。
为了介绍和宣传cellPAINT,四位开发者还认真写了篇文章,号召大家使用软件的时候引用一下。“Garner A, Autin L, Barbaro B, Olson AJ & Goodsell DS. (2018) CellPAINT: Interactive Illustration of Dynamic Mesoscale Cellular Environments. IEEE Computer Graphics and Applications 38(6), 51-66. ”
画完之后点击温度计,看那些小分子群魔乱舞,是不是很好玩?如果觉得好,也欢迎分享到朋友圈,让更多人一起玩!
软件在线版,马上点击试一试:
http://mgldev.scripps.edu/projects/cellPAINT/index.html