冯梓恒 , 谢正德 , 许黎黎
2025, 40(2): 147
doi: 10.1016/j.virs.2025.01.003
收稿日期: 2024-08-05
录用日期: 2025-01-25
呼吸道合胞病毒（RSV）是导致全球儿童和老年人下呼吸道感染（LRTIs）的最常见病毒病原体之一。近年来，RSV感染的预防和治疗取得了不少进展。2023年美国食品药品监督管理局（FDA）先后批准了两种抗RSV疫苗和一种单克隆抗体。但在临床实践中仍然缺乏RSV感染后的抗RSV治疗药物。近年来，随着对RSV致病机制理解的不断加深，一些候选药物展现出了巨大的临床应用潜力。在本综述中，我们对过去五年内处于临床前或临床开发阶段的有前景的抗RSV候选药物进行了总结及讨论。
李怡哲 , 刘敏洁 , 梁景耀 , 叶横明 , 吕明翠 , 陈德林 , 梁琳悦 , 张书晴 , 张柯新 , 安树 , 周文乐 , 吴珏珩 , 朱勋 , 何振健
2025, 40(2): 157
doi: 10.1016/j.virs.2025.03.004
收稿日期: 2024-10-27
录用日期: 2025-03-14
人副流感病毒（Human parainfluenza viruses, HPIV）是引发急性呼吸道感染（Acute respiratory infection, ARI）的重要病原体。本研究旨在阐明我国南方地区HPIV感染的流行病学及分子特征。这项横断面研究收集了2016-2020年南方地区9696例急性呼吸道感染患者的呼吸道样本，采用实时定量PCR检测HPIV及其他常见呼吸道病毒。通过描述性统计分析明确HPIV的时空分布特征及人群特征，并对HPIV3阳性样本的血凝素-神经氨酸酶（HN）基因全长进行测序及系统进化分析。结果显示：本研究共检出HPIV阳性病例577例（6.0%），其中HPIV3为主要血清型（46.8%）；66.0%的阳性病例为0-2岁婴幼儿。2016-2020年间，HPIV感染呈现总体下降趋势且流行高峰发生改变。感染HPIV主要表现为咳嗽、发热、咳痰及流涕。63.4%患者被诊断为肺炎。合并感染以人鼻病毒（HRV，20.1%）和人冠状病毒（HCoV, 14.4%）最为常见。系统进化分析表明HPIV3主要流行谱系为C3f（86.0%），其次为C3a（8.0%）、C3d（4.0%）和C3b（2.0%）。以上结果为深入理解我国南方地区HPIV的流行特征，完善HPIV感染的公共卫生防控策略提供了科学依据。
李良玉 , 张海月 , 熊佩 , 刘潺 , 万璐 , 刘梦玲 , 毛婕钰 , 李瑞云 , 商敏 , 刘海玲 , 罗豫川 , 殷静 , 吴小军 , 陈建军
2025, 40(2): 166
doi: 10.1016/j.virs.2025.03.005
收稿日期: 2025-01-31
录用日期: 2025-03-17
确定肺部感染的病因对于减少诊断和治疗负担至关重要。为了评估住院的肺部感染患者（包括下呼吸道感染、结核病、肺癌和肺结节患者）的病毒病因，本研究收集了2020年11月至2021年11月期间非COVID-19成人肺部感染患者的支气管肺泡灌洗液（BALF）标本（n = 333）。采用多重逆转录聚合酶链反应检测常见的呼吸道病原体。结果显示，在333例案例中至少识别到一种病毒的比例为35.44%（118/333）。其中，流感病毒是检出率最高的病毒，其次是副流感病毒、冠状病毒、鼻病毒和呼吸道合胞病毒。在结核病组观察到的病毒检出率最高，而共感染几率最低。相比之下，共感染频率最高的是肺结节组。与未检测到病毒感染的患者相比，感染病毒的患者表现出更严重的临床症状。然而，这一观察仅在下呼吸道感染组中得到确认。此外，在特定病毒感染的患者中，单一感染和共感染之间的病毒载量没有显著差异。我们的研究确定了住院成人患者肺部感染的主要病原体，为精确诊断疾病和预防抗菌药物的非必要使用提供了依据。
潘玉迪 , 李子鑫 , 缪茜 , 时洪艳 , 郭龙军 , 冯力 , 田进
2025, 40(2): 176
doi: 10.1016/j.virs.2025.02.003
收稿日期: 2024-09-30
录用日期: 2025-02-12
G9基因型轮状病毒作为一种新的基因型，目前在人和猪中广泛流行，近年来在全球多个国家和地区均有报道。而且猪G9毒株可跨越种间屏障感染人。本研究对2020—2023年我国多省份猪场流行的G9基因型进行流行病学调查，了解G9基因型毒株的流行趋势及不同分离株之间的交叉免疫反应性。共鉴定出9株代表性毒株，VP7基因系统进化分析显示，这些毒株主要分布在III和VI谱系中，为我国G9基因型的流行毒株。此外，发现了一个新的谱系VII，该谱系的毒株在广东和台湾地区流行。除谱系I和IV外，其他谱系的一些分离株可在猪和人中共同流行。在G9最大的分支III中共分离到3株G9毒株，分别为923H、923E和923X。中和试验结果显示同一或不同谱系的毒株之间存在明显的交叉反应。本研究首次系统地研究了中国猪G9基因型轮状病毒的遗传和免疫遗传特征，提示了猪与人之间潜在的跨种传播，为猪轮状病毒的有效预防提供了有价值的方向。
涂忠忠 , 王通 , 徐钰 , 孙贺廷 , 彭鹏 , 秦思源 , 涂长春
2025, 40(2): 186
doi: 10.1016/j.virs.2025.02.002
收稿日期: 2024-12-11
录用日期: 2025-02-13
暂时热病毒（EVs）是由节肢动物传播的弹状病毒，此前仅可从牛和噬血节肢动物中分离得到，直到最近才首次从家猪中鉴定出两种新型暂时热病毒。本研究通过宏转录组测序，在野猪中鉴定出一种新的暂时热病毒。通过特异性RT-nPCR方法对2018年至2023年间从中国26个省收集的459头外表健康的野猪组织样本进行进一步筛查，结果在其中4个省的5头野猪呈暂时热病毒阳性。此外，从2头阳性野猪身上采集的2只蜱虫也呈暂时热病毒阳性。最终，我们获得了4个野猪暂时热病毒（WbEVs）的全基因组序列，其中2个属于新的暂时热病毒种，其余2个与从家猪中鉴定出的猪暂时热病毒2（PoEV2）属于同一个种。本研究进一步扩大了暂时热病毒宿主范围，并证明了野猪中存在不同的暂时热病毒的自然循环，且蜱虫可能在其中发挥重要作用。野猪感染暂时热病毒的生物学影响值得未来深入探究。
王旭刚 , 钱超男 , 张晨曦 , 胡思云 , Muhammad Asad , 杨诚洁 , 廖冰蕊 , 郭晓彤 , 张晨 , 李权智 , 李鑫瑶 , 黄求应 , 司有辉 , 朱碧波 , 曹胜波 , 叶静
2025, 40(2): 192
doi: 10.1016/j.virs.2025.02.001
收稿日期: 2024-07-13
录用日期: 2025-02-07
寨卡病毒 (ZIKV) 是一种以蚊虫为媒介传播的病毒，属于黄病毒科正黄病毒属。ZIKV感染能导致成年人的吉兰-巴雷综合症，孕妇出现妊娠并发症及新生儿的小头畸形，而目前还没有商业疫苗或特效药来预防或治疗ZIKV感染。控制ZIKV的传播和爆发主要依赖于防止蚊虫传播病毒。尽管现有研究探讨了ZIKV在蚊虫和脊椎动物宿主之间的传播，但是对寨卡病毒在蚊虫间传播潜力的系统研究仍显不足。在这项研究中，我们进行了系统的实验室研究，以评估ZIKV在蚊虫之间传播病毒的能力，并评估ZIKV感染对蚊虫发育的影响。我们的研究结果表明，ZIKV阳性埃及伊蚊可以与相同或不同性别蚊虫通过水平接触传播病毒，还可以在交配后将ZIKV垂直传播给子代蚊虫。此外，ZIKV感染会导致子代蚊虫卵的数量减少而尺寸增大。ZIKV感染后在蚊虫各组织器官中广泛分布，病毒感染后激素相关基因改变，这可能有助于病毒在蚊群之间的传播，并影响蚊虫的发育。这项研究系统性提供了ZIKV在蚊虫间水平和垂直传播的实验证据，这对开发新策略来阻断ZIKV和其他蚊媒病原体的传播至关重要。
魏颖 , 邹创超 , 曾思莹 , 彭欧阳 , 胡广利 , 黄逸晖 , 徐秋萍 , 胡方昱 , 曹永长 , 张灏
2025, 40(2): 206
doi: 10.1016/j.virs.2025.03.002
收稿日期: 2025-01-02
录用日期: 2025-03-11
猪繁殖与呼吸综合征（PRRS）是由猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）引起的高度传染性免疫抑制性疾病，已对全球养猪业造成重大经济损失。鉴于PRRS防控的复杂性及现有疫苗效力有限，亟需明确抗病毒靶点并开发有效治疗手段。从病毒-宿主互作视角解析与抗PRRSV相关的靶分子，可为疾病防控提供新策略。本研究采用数据非依赖型采集（DIA）模式开展定量蛋白质组学研究，系统探究PRRSV急性感染期的宿主应答动态。本研究结果揭示了病毒感染急性期宿主抗病毒及免疫通路的调控特征，深化了对PRRSV-宿主互作机制及宿主基因动态的理论认知。尤为重要的是，我们发现与胆固醇代谢密切相关的溶酶体膜关键蛋白SCARB2具有调控PRRSV复制的潜在功能。这些发现为PRRSV防控提供了新思路，有助于开发靶向抗病毒策略。
谢承作 , 金侠 , 李万维 , 王建华
2025, 40(2): 217
doi: 10.1016/j.virs.2025.03.007
收稿日期: 2024-12-04
录用日期: 2025-03-18
Naf1是与人免疫缺陷病毒Ⅰ型(HIV-1)编码蛋白 Nef相互作用的宿主蛋白。我们以及其他团队曾发现Naf1可抑制HIV-1在T淋巴细胞中的感染。髓系来源的细胞（如单核细胞，树突状细胞等）也是HIV-1感染的靶细胞之一。但髓系细胞中Naf1的表达情况以及其表达是否可调控HIV-1复制尚不清楚。本研究发现，Naf1在CD14+ 单核细胞中的表达水平显著高于其分化的树突状细胞（Monocyte-derived Dendritic Cells , MDDCs），且HIV-1 gp120糖蛋白或病毒颗粒刺激均可诱导Naf1在两种细胞中的表达。重要的是，Naf1的表达可抑制HIV-1在单核细胞和MDDCs中的复制。功能分析显示，无论是组成型表达还是诱导型表达的Naf1均可通过抑制MDDCs中的NF-κB信号通路， 降低本底水平或脂多糖（Lipopolysaccharide , LPS）刺激诱导的细胞因子产生。此外，Naf1还能降低MDDCs表面的细胞间黏附分子-1（Intercellular Cell Adhesion Molecule-1, ICAM-1）表达，从而削弱MDDCs在共培养条件下激活静息CD4+ T细胞的能力。鉴于NF-κB信号通路在HIV-1转录中的重要性，Naf1介导的NF-κB信号抑制作用可能会通过阻碍MDDCs中病毒的过度复制，从而帮助维持HIV潜伏。此外，病毒诱导的Naf1还可通过削弱树突状细胞与T细胞间的相互作用，抑制T细胞的激活从而抑制抗病毒免疫应答。综上，此工作揭示了Naf1在髓系细胞中的新功能，有助于深入理解髓系细胞限制HIV-1感染的机制。
王培 , 田步云 , 肖珂 , 纪伟 , 李总红
2025, 40(2): 225
doi: 10.1016/j.virs.2025.03.010
收稿日期: 2024-12-24
录用日期: 2025-03-24
严重急性呼吸综合征冠状病毒2 （SARS-CoV-2）的进化不仅导致帮助免疫逃避的刺突蛋白发生突变，而且导致对调节双膜囊泡（DMV）形成至关重要的NSP3/4/6蛋白发生突变。然而，这些NSP3/4/6突变的功能后果仍然知之甚少。本研究系统分析了NSP3/4/6突变的进化模式及其对DMV形成的影响。研究结果显示，NSP4 T492I突变（在所有Delta和Omicron亚系中发现的一种普遍突变）显著增强了DMV的形成。从机制上来看，NSP4 T492I突变增强了其同源二聚化，导致NSP3/4诱导的斑点大小增加，并且内质网（ER）膜曲率也会增加，导致每个荧光斑点的DMV密度更高。这项研究强调了NSP4 T492I突变在调节DMV形成中的重要性，并可能对SARS-CoV-2的传播动态具有潜在影响。它为这些突变如何影响病毒复制和发病机制提供了有价值的见解。
赵海帆 , 汪莹 , 刘晓红 , 刘献辉 , 耿直 , 高增强 , 黄丽 , 翁长江 , 董宇辉 , 张衡
2025, 40(2): 236
doi: 10.1016/j.virs.2025.03.013
收稿日期: 2024-07-24
录用日期: 2025-03-27
非洲猪瘟病毒（ASFV）pB318L 是病毒复制的一个重要细胞膜结合蛋白，它作为一个异戊二烯合成酶，通过催化异戊烯基二磷酸（IPP）与烯丙基二磷酸的缩合生成法尼基二磷酸（FPP）和香叶基香叶基焦磷酸（GGPP）等类异戊二烯化合物。近期我们解析了缺失 N 端跨膜区的 pB318L 晶体结构，并进行了初步结构分析。在本研究中，基于结构的突变分析和 GGPP 生成定量测定进一步揭示了pB318L中发挥酶活的关键残基。通过进一步的结构比较发现，pB318L 与典型的 GGPP合成酶显示出很强的相似性，而与负责蛋白异戊烯化修饰的异戊烯基转移酶有明显的差别。系统发育分析表明，pB318L 可能与十字花科植物的GGPP合成酶具有共同祖先，而与天然宿主中的GGPP合成酶进化关系较远。亚细胞定位分析表明，pB318L 定位于细胞核和细胞质（包括内质网膜和线粒体外膜）。我们在在 pB318L 中发现了一个独特的 N 端核定位信号（NLS），并且证实了该 NLS 对于核输入是必需的。我们进一步揭示了该NLS在与核转运蛋白 KPNA1 相互作用中起着关键作用。它们之间的相互作用可能会抑制信号转导及转录激活因子 1（STAT1）的转位，进而竞争性地抑制干扰素刺激基因因子 3（ISGF3）复合物的核输入。我们的生化、结构和细胞分析为 pB318L功能提供了新的线索，证实了它既是一种促进病毒复制的必需的异戊烯焦磷酸合酶，也是一种可能参与非洲猪瘟病毒免疫逃逸的核输入蛋白。
赵悉雯 , 代璇 , 王富艺 , 李晨阳 , 宋勋 , 韩颖颖 , 张晁玮 , 王露 , 贺震旦 , 张荣平 , 叶亮
2025, 40(2): 247
doi: 10.1016/j.virs.2025.03.001
收稿日期: 2024-09-27
录用日期: 2025-02-26
黄花蒿（Annua L.）是一种具有多重治疗应用价值的药用植物，然而其对甲型流感病毒（IAV）的抑制效果及其作用机制尚不清楚。在本研究中，我们探究了黄花蒿叶的甲醇提取物（AALME）在体外和体内对IAV的抑制活性及其作用机制。研究结果表明，AALME通过与IAV病毒颗粒直接相互作用发挥显著的抗IAV效果。AALME能够直接靶向IAV核蛋白（NP），并阻断NP向核内运输。此外，AALME能够显著抑制IAV诱导的线粒体凋亡，通过抑制活性氧（ROS）介导的AIF依赖性途径实现。更重要的是，我们发现AALME在保护小鼠免受IAV感染以及减轻IAV致病性方面发挥着关键作用。本研究为AALME在体外和体内抑制IAV感染的机制进行了探索，并为开发针对IAV的抗病毒治疗策略提供参考。
石茜茜 , 王梓凝 , 刘子翔 , 林沁婷 , 黄梦倩 , 林治延 , 李晓燕 , 王涛
2025, 40(2): 260
doi: 10.1016/j.virs.2025.03.011
收稿日期: 2024-09-25
录用日期: 2025-03-25
发热伴血小板减少综合征（Severe fever with thrombocytopenia syndrome, SFTS）是一种由发热伴血小板减少综合征病毒（Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus, SFTSV）引起的新型急性传染病，以高热和血小板减少为主要特征。已有研究表明，中药（Traditional Chinese Medicine, TCM）对病毒性出血热具有明确的治疗效果，提示其在治疗SFTS方面具有潜力。本研究通过GO分析和京都基因与KEGG富集分析预测了SFTS相关的关键靶点，并利用分子对接技术筛选出稳定的结合分子。通过匹配中药成分，我们组成了一个具有清热养血功效的新方剂——清气固血方（QQGX），并构建了其药物成分网络。我们进一步探索了QQGX的最佳药物配比。通过对分子机制的深入研究，我们发现QQGX通过促进细胞周期蛋白A2（Cyclin A2, CCNA2）和细胞周期依赖性激酶2（Cyclin-dependent kinase 2, CDK2）的降解，诱导S期阻滞，从而抑制SFTSV的复制。最后，基于SFTSV感染的小鼠肝胆管类器官模型，我们验证了QQGX的有效性和安全性。综上所述，本研究利用网络药理学方法制备了一种中药复方，该复方对SFTSV的复制具有显著抑制作用，并为中医药治疗出血热提供了新的治疗策略。
唐婕琳 , 陈思杰 , 钟溢 , 邓奕君 , 黄丹 , 刘军君 , 郑义 , 徐霁源 , 薛豹 , 王帆 , 周缘 , 王汉中 , 杨琪 , 陈新文
2025, 40(2): 275
doi: 10.1016/j.virs.2025.03.009
收稿日期: 2024-09-30
录用日期: 2025-03-21
人博卡病毒Ⅰ型（human bocavirus 1, HBoV1）是一种常见的呼吸道病原体，感染引起发烧、咳嗽等呼吸道相关症状，在婴幼儿和免疫功能低下的老年人群中容易引起轻度至危及生命的急性呼吸道感染。由于缺乏敏感细胞系模型和实验动物模型，严重阻碍了HBoV抗病毒药物和疫苗研发的进展。构建带有marker标记的HBoV1重组感染性克隆，使之应用于HBoV1抗病毒药物评估等，为HBoV1病毒学研究提供关键技术支持具有重要意义。本研究成功构建了五个不同插入位点带有HiBiT标签的HBoV1感染性克隆。通过检测HBoV1 DNA拷贝数、NanoLuc荧光素酶活性、病毒蛋白表达以及复制中间体形成，发现只有HiBiT插在NS1 N端（命名为HBoV1-HiBiTNS1）对HBoV1复制影响较小。同时，通过时相检测HBoV1病毒复制与NanoLuc荧光素酶酶活变化，发现两者趋势一致，并呈现显著相关性。此外，本研究成功应用带有HiBiT标记的HBoV1重组病毒评估了小分子药物抗HBoV1病毒复制的能力，鉴定出伊维菌素（半数有效浓度EC50=2.27 μM）具有抑制HBoV1复制的潜力。综上，HBoV1-HiBiTNS1重组感染性克隆不仅为高通量筛选抗HBoV1病毒复制的药物提供了便捷平台，也为深入研究HBoV1生命周期奠定了技术基础。
孙仁杰 , 冯肖肖 , 黄靖 , 郑方宇 , 谢荣辉 , 张传亮 , 张红丽 , 薛银 , 刘爱军 , 黄晓兵 , 原霖 , 赵灵燕
2025, 40(2): 284
doi: 10.1016/j.virs.2025.01.002
收稿日期: 2024-08-12
录用日期: 2025-01-17
野鸟是禽流感病毒的自然宿主和储存库，在禽流感病毒的进化与传播中发挥着关键作用。本研究团队于2024年6月在中国东部的野鸟组织样本中分离到了一株新型H5N6高致病性禽流感病毒，A/wild bird/Zhejiang/NBXS-1/2024 (H5N6)。通过高通量测序技术，我们获得分离病毒的全基因组，并对其进行了遗传进化分析和分子特征研究。结果显示该病毒的八个内部基因均与2022-2023年在日本和韩国候鸟中发现的禽流感病毒具有较高的同源性（99.08%-99.80%），表明其传播可能与候鸟迁徙有关。其中HA基因来自2.3.4.4b分支，很可能源自日本的野鸟源H5N1禽流感病毒。其他七个内部基因的系统发育分析进一步表明，该病毒为野鸟中的H5高致病性禽流感病毒和其他低致病性禽流感病毒的基因重组进化产生的新型病毒。综上所述，本研究有助于揭示野鸟中H5Nx 2.3.4.4b分支病毒的演化动态，同时也强调了持续加强监测野生鸟类和家禽中H5N6流感病毒传播和进化的必要性。
彭友松 , 杨磊 , 黄维娟 , 刘米 , 丁啸 , 杜向军 , 舒跃龙 , 蒋太交 , 王大燕
2025, 40(2): 288
doi: 10.1016/j.virs.2025.01.004
收稿日期: 2024-11-13
录用日期: 2025-01-24
疫苗接种是目前预防流感病毒感染的最有效手段。然而，流感病毒突变快，其抗原也容易发生变化，导致流感疫苗效力降低甚至失效。因此，我们需要及时地监测流感病毒发生的抗原变异，并及时更换疫苗株。在之前的工作中，我们开发了基于流感病毒血凝素蛋白序列和人工智能算法来推荐流感疫苗的方法（命名为PREDAC），该方法相对于世界卫生组织的流感疫苗推荐方法更加容易使用，且自动化程度更高。从2013年开始，我们使用PREDAC方法为H3N2流感病毒推荐疫苗株。本文系统总结了PREDAC在过去十年（2013-2023）推荐流感疫苗株的效果。自2013年以来，PREDAC共进行了19次疫苗推荐，其中12次推荐的疫苗株与实际流行毒株具有相同或相似的抗原性，其表现与世界卫生组织的方法相当。疫苗推荐差异的情况中大多数（6/7）是由于在疫苗推荐时几乎没有或只有极少的未来流行株类似毒株的序列。为了进一步改进流感疫苗推荐的效果，需要继续加强对于流感病毒抗原变异的监测，并开发更先进的计算方法。
李琛 , 周蒙 , 赵凯涛 , 刘文博 , 祝成亮 , 程晓明 , 夏宇尘
2025, 40(2): 292
doi: 10.1016/j.virs.2025.02.004
收稿日期: 2024-11-09
录用日期: 2025-02-23
SMPD3被鉴定为一种新型宿主因子，可在转录水平抑制乙型肝炎病毒（HBV）复制。SMPD3敲降在多种细胞模型中增强HBV复制，导致HBsAg、HBeAg及HBV DNA水平升高。机制研究表明，SMPD3抑制HBV转录，但不影响RNA稳定性或启动子活性。
胡艺欣 , 李泽辉 , 郝晨琳 , 路浩 , 邢云飞 , 刘可心 , 靳晓慧 , 魏战勇
2025, 40(2): 296
doi: 10.1016/j.virs.2025.03.003
收稿日期: 2024-11-23
录用日期: 2025-03-11
猪星形病毒（PAstV）是一种新发现的猪肠道病毒，可引起猪腹泻，特别是新生仔猪腹泻。目前，还没有针对PAstV的商业疫苗和药物。PAstV衣壳蛋白可与宿主细胞受体结合，是中和抗体的主要目标。本研究利用原核表达系统表达PAstV5衣壳蛋白的优势抗原区域。用纯化后的蛋白免疫BALB/c小鼠，获得一株单克隆抗体6C6（mAb 6C6）。间接ELISA结果显示mAb 6C6重链的亚型为IgG1，轻链的亚型为kappa。免疫荧光法和免疫印迹法显示mAb 6C6对PAstV5具有较强的特异性。中和实验结果显示，mAb 6C6对PAstV5具有一定的中和作用。此外，通过免疫印迹分析，精确定位了mAb 6C6识别的表位。mAb 6C6识别的最小抗原表位是PAstV衣壳蛋白的109NFVRQ113氨基酸残基。对PAstV Cap的三维结构分析表明，被mAb 6C6识别的表位形成了一个α螺旋结构，并位于该蛋白外部。本研究中首次鉴定PAstV5特异性保守B细胞表位，将有助于研发PAstV5的诊断试剂和治疗药物。
