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当期论文

Special Issue: SARS-CoV-2 and COVID-19 (II) 

Issue Editor: Zheng-Li Shi, PhD, Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences

By the end of November 2020, SARS-CoV-2—the new coronavirus behind the disease COVID-19—has infected over 60 million people around the world and caused about one and a half million deaths. Facing the biggest global pandemic of the century, doctors, scientists and the scientific community have been working hard to uncover the pathogenesis and search for effective scientific solutions. Virologica Sinica has online published a series of original articles and reviews on SARS-CoV-2 and COVID-19, covering topics on clinical cohorts/cases and disease features, virus characterization and surveillance, diagnosis and improved methods, antiviral agents and therapeutic treatment, and etc, and they are collectively presented in this special issue. Those researches have greatly advanced our understandings of and empowered our strength to combat the disease. The cover depicts the SARS-CoV-2 virus particle, surrounded by human blood cells.

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Review

新型冠状病毒的基因组、结构、受体和起源

王仕川, TrillingMirko, SutterKathrin, DittmerUlf, LuMengji, 郑昕, 杨东亮, 刘嘉

2020, 35(6): 673 doi: 10.1007/s12250-020-00298-z

收稿日期: 2020-07-20 录用日期: 2020-08-31 出版日期: 2020-10-17
[HTML全文] [PDF 749 KB] Springerlink
最近出现的严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)在全球迅速蔓延,造成了前所未有的医疗和社会经济危机,由其引发的疾病--2019冠状病毒病(COVID-19)于2020年3月11日被世界卫生组织宣布为大流行。中国科学家和医生迅速鉴定了病原体,结果发现这是一种与蝙蝠和穿山甲冠状病毒有很高序列相似性的新型β冠状病毒。科学界正竭力解释SARS-CoV-2的生物学特性,以期奠定相关疾病治疗和疫苗研发策略的基础。本文就SARS-CoV-2的基因组、结构、受体和起源等方面的研究现状进行综述。

新型冠状病毒疾病:抗病毒药物、抗体及中药研究进展

管文艺, 蓝文东, 张静, 赵珊, 欧俊贤, 吴晓薇, 严雨茜, 吴建国, 张其威

2020, 35(6): 685 doi: 10.1007/s12250-020-00297-0

收稿日期: 2020-07-03 录用日期: 2020-08-31 出版日期: 2020-09-30
[HTML全文] [PDF 348 KB] Springerlink
世界卫生组织(WHO)宣布2019年底出现的由新型冠状病毒SARS-CoV-2引起的冠状病毒疾病(COVID-19)是第一个冠状病毒全球大流行。目前世界上还未出现有效的抗SARS-CoV-2药物获批用于治疗COVID-19患者,因此迫切需要提供多种治疗选择应对新冠病毒疾病暴发。为促进新冠肺病毒治疗药物的更好和更快发展,并为临床治疗提供参考意见,我们在此介绍一些有发展前景的治疗药物,包括现存的抗病毒药物的老药新用、基于网络的药理学研究、抗体开发和中药发展。其中部分药物已进入最后一个临床试验阶段。

中国国家药品监督管理局批准的SARS-CoV-2检测试剂盒及其在COVID-19诊断中的应用

阿茹罕, 王慧娟, 王文玲, 谭文杰

2020, 35(6): 699 doi: 10.1007/s12250-020-00331-1

收稿日期: 2020-07-23 录用日期: 2020-11-25 出版日期: 2020-12-22
[HTML全文] [PDF 1137 KB] Springerlink
由严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)引起的2019冠状病毒病(COVID-19)已在全球流行11个月之久。截止2020年11月20日,SARS-CoV-2核酸检测试剂盒(24个)、抗体检测试剂盒(25个)或抗原检测试剂盒(2个)已由中国国家药品监督管理局(NMPA)批准。为有效控制新冠大流行,全球急需方便、可靠的SARS-CoV-2检测方法。本文对中国已经获批的可用于COVID-19诊断的核酸检测、血清学检测和抗原检测方法及试剂进行了总结和讨论。新型检测试剂盒的开发将为全球COVID-19大流行的防控奠定基础。

靶向新冠病毒的人源单克隆抗体及其中和表位的研究进展

陈俊森, 黄锐, 聂奕雯, 温心月, 吴莹

2020, 35(6): 713 doi: 10.1007/s12250-020-00327-x

收稿日期: 2020-08-24 录用日期: 2020-11-11 出版日期: 2021-01-04
[HTML全文] [PDF 486 KB] Springerlink
2020年新型冠状病毒的全球肆虐,给人类造成了不可估量的损失。目前尚无针对新型冠状病毒的特异性药物,而中和抗体因其特异、高效等优势,为抗病毒治疗带来了新的希望。本文介绍了新型冠状病毒病原学及血清学特点,同时对新冠病毒的人源单克隆抗体的结合活性、中和效果和抗原表位作了系统阐述。为人体应对新型冠状病毒的免疫识别与应答的机制提供线索,为高效疫苗的设计和评价及抗体免疫治疗的策略提供思路。
Research Article

来氟米特治疗新型冠状病毒感染的小规模临床同情药物观察

胡克, 王梦枚, 赵杨, 张韵婷, 王涛, 郑志水, 李晓尘, 曾少林, 赵东, 李洪林, 徐可, 蓝柯

2020, 35(6): 725 doi: 10.1007/s12250-020-00258-7

收稿日期: 2020-06-03 录用日期: 2020-06-16 出版日期: 2020-07-21
[HTML全文] [PDF 678 KB] Springerlink
摘要:我们的最新研究发现人二氢乳清酸脱氢酶(DHODH)的抑制剂具有广谱抗病毒活性,在感染细胞中可以有效抑制新型冠状病毒的复制。然而,还未有临床数据证明DHODH抑制剂在新型冠状病毒病感染(COVID-19)的患者中具有治疗效果。本研究中,我们评估了一种已经上市并广泛用应用于自身免疫病治疗的DHODH抑制剂,来氟米特(Leflunomide),在小范围COVID-19患者中同情用药的效果。研究招募了10例实验室确诊的普通型COVID-19患者,其中5名患者接受了来氟米特治疗,另外5名患者为空白对照组(没有使用安慰剂),所有患者都接受了新型冠状病毒感染的标准支持治疗方案。结果表明,服用来氟米特的患者比对照组的排毒时间明显缩短,用药组排毒时间中位数为5天,而对照组排毒时间中位数为11天(P=0.046)。服用来氟米特的患者在用药后C反应蛋白水平也显著下降,表明炎症反应得到了很好的控制。在来氟米特治疗的患者中,没有观察到明显的不良反应,能在短期康复出院。这项小规模的同情用药初步研究为进一步了解来氟米特作为抗新型冠状病毒感染的潜在药物提供了线索。

COVID-19患儿的细胞因子轻度升高,CD4+T细胞应答适中且抗体产生充足

贾然, 王相诗, 柳鹏程, 梁小珍, 葛艳玲, 田鹤, 常海岭, 周浩, 曾玫, 徐锦

2020, 35(6): 734 doi: 10.1007/s12250-020-00265-8

收稿日期: 2020-07-02 录用日期: 2020-07-06 出版日期: 2020-07-22
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研究发现SARS-CoV-2感染患者中,儿童感染者的临床表现轻于且预后好于成人感染者,但关于儿童与成人感染者的免疫应答之间的差异尚未见报道。本研究中,我们收集了19例COVID-19患儿发病后不同阶段的血清和全血细胞。分别检测细胞因子浓度、SARS-CoV-2 S-RBD和N蛋白特异性抗体水平和T细胞免疫应答情况。结果显示,在检测的12种细胞因子中,COVID-19患儿只有3种细胞因子在感染后急性期显著升高,即干扰素(IFN)诱导蛋白10 (IP10)、白介素(IL)-10和IL-16。在急性期,我们观察到患儿的T辅助(Th)2细胞明显增加,调节性T细胞(Treg)显著受抑,但患儿的CD8+T细胞的IFN-?或TNF-?分泌水平均未见明显变化。S-RBD和N蛋白特异性IgM在急性期即出现,而S-RBD和N蛋白特异性IgG在中期开始出现并迅速升高,且在恢复期仍未见下降趋势。IgA以S-RBD特异性为主,N特异性IgA似乎诱导不明显。总之,COVID-19患儿免疫应答的炎症反应整体轻于成人,表现为细胞因子升高不显著,CD4+T细胞应答适中,且CD8+T细胞应答不明显。但是COVID-19患儿产生的针对SARS-CoV-2的体液免疫并不弱于成人。我们的发现揭示了COVID-19儿童患者的免疫学特征,其可能为儿童感染SARS-CoV-2后病情较轻的原因提供线索。

COVID-19爆发早期患者SARS-CoV-2抗体的动态变化

舒化青, 王素珍, 阮淑兰, 王雅鑫, 张建成, 袁茵, 刘宏, 吴永然, 李瑞婷, 潘尚文, 欧阳雅淇, 袁世荧, 周鹏, 尚游

2020, 35(6): 744 doi: 10.1007/s12250-020-00268-5

收稿日期: 2020-05-11 录用日期: 2020-06-15 出版日期: 2020-07-27
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SARS-CoV-2引起的COVID-19已全世界流行,死亡率高。快速而准确地诊断对于有效控制其大流行极其重要,SARS-CoV-2抗体的动态变化特点对该病毒感染的诊断的重要性尚未完全清楚。在该单中心、观察性、回顾性研究中, 我们收集了最初收入金银潭医院至少行一次抗体检测的131例COVID-19住院患者,总共ELISA检测226份血清SARS-CoV-2的IgM IgG抗体,分析了其敏感性。结果显示IgG的敏感性(92.5%)显著高于(70.8%) (P < 0.001)。IgM和IgG血清转化的平均时间分别为6天和3天,达峰时间分别为18天和23天,然后IgM大约在36天转阴,而IgG持续维持较高水平。结论:抗体检测有助于COVID-19的临床诊断,IgG可以作为回顾性诊断的敏感指标,而IGMO可能作为早期感染的指标。

不同临床分型的新型冠状病毒病例中的新冠病毒血清学反应

孔雯骅, 赵荣, 周军波, 王芳, 孔德广, 孙建斌, 阮琼芳, 刘满清

2020, 35(6): 752 doi: 10.1007/s12250-020-00270-x

收稿日期: 2020-05-31 录用日期: 2020-07-07 出版日期: 2020-07-23
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新冠肺炎(COVID-19)在全球的快速扩散和大流行,要求我们更加深入地认识该疾病的免疫学特征,包括基本免疫指标出现的时序。本研究纳入了88名来自武汉的新冠病例,其确诊时间为2020年一至二月,包括32名临床分型为重型/危重型的病例和56名轻型/普通型病例。病例平均年龄56.43岁、年龄范围17至83岁、男女性别比为43:45。我们使用商用试剂检测了病例呼吸道标本的新冠病毒核酸,使用磁微粒化学发光法检测了其血样中的新冠IgM和IgG抗体水平,并分析其与疾病严重程度的相关性。血清学与核酸联合检测在88名病例中确认了84名新冠感染阳性者,阳性率为95.45%,显著高于单纯核酸检测(73.86%)或单纯血清学检测(65.91%)(P < 0.001)。我们进一步分析了新冠抗体反应的时间顺序,结果显示血清抗体转换始于症状出现后的第五天,且IgG抗体出现早于IgM。对不同临床分型病例的比较显示较早的血清抗体转换和高抗体水平可能与较轻的临床症状有关。以上结果支持在常规新冠感染诊断中应用血清-核酸联合检测,同时也为理解不同临床分型病例间抗体反应的差别提供了证据。

SARS-CoV-2 RNA的RT-PCR检测中使用样本内参能有效避免假阴性

张亚飞, 王长泰, 韩明锋, 叶珺, 高勇, 刘忠萍, 贺腾飞, 李团团, 徐梦园, 周鲁平, 邹桂舟, 陆蒙吉, 张振华

2020, 35(6): 758 doi: 10.1007/s12250-020-00273-8

收稿日期: 2020-05-25 录用日期: 2020-07-15 出版日期: 2020-08-04
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逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)是特异性诊断SARS-CoV-2感染的重要方法。不幸的是,假阴性测试结果经常被报道。在本研究中,我们试图确定RT-PCR检测呼吸道标本中SARS-CoV-2 RNA假阴性的主要原因。使用针对SARS-CoV-2基因组的ORF1ab和N区域的商用荧光RT-PCR试剂盒对161例确诊的COVID-19患者的多个痰液和咽喉拭子标本进行了检测。通过RT-PCR检测患者呼吸道细胞管家基因核糖核酸酶P/MRP亚基p30 (RPP30)的RNA水平,对总共1052份样本的数据进行了回顾性再分析,发现SARS-CoV-2 RNA检测阳性结果与呼吸道标本中高水平RPP30 RNA之间存在很强的相关性。通过ROC-AUC分析,我们确定了RPP30 RT-PCR的Ct截值,可以高灵敏度(95.03%-95.26%)和高特异性(83.72%-98.55%)地预测不同标本类型中SARS-CoV-2 RT-PCR检测的假阴性结果。因此,宿主细胞取材的多少是SARS-CoV-2 RNA检测正确的关键,RPP30可以作为细胞含量的指标,也可以作为标本采集质量的替代指标。此外,我们的结果显示,在RT-PCR检测SARS-CoV-2 RNA时,绝大多数结果都是假阴性。

长程SARS-CoV-2 RNA阳性的患者使用恢复期血浆治疗的疗效分析:一项观察性回顾性研究

吴永然, 洪可, 阮连国, 杨小博, 张建成, 徐继前, 潘尚文, 任乐豪, 陈露, 黄朝林, 尚游

2020, 35(6): 768 doi: 10.1007/s12250-020-00281-8

收稿日期: 2020-07-09 录用日期: 2020-08-03 出版日期: 2020-08-31
[HTML全文] [PDF 459 KB] Springerlink
近期研究显示,少部分C0VID-19患者恢复期血浆输注治疗。然而,对于长时间SARS-COV-2阳性的患者而言,目前仍无相关报道恢复期血浆治疗是否可以临床获益。因此,我们进行了一项回顾性的观察研究,目的是分析长程SARS-COV-2阳性的患者输注恢复期血浆是否受益。本研究纳入了27名接受了恢复期血浆治疗的长程SARS-COV-2阳性的患者。在接受恢复期血浆治疗后,部分患者在7天内核酸检测结果转为阴性(早期转阴组,n=15),另一部分患者核酸检测转阴时间大于天(n=12,晚期转阴组)。通过对两组之间的病毒载量连续比较发现,早期转阴组在第3、5、7天的病毒载量明显较晚期转阴组下降。早期转阴组患者住院时间明显缩短,且通过输注恢复期血浆前后影像学分析发现,两组患者在恢复期血浆治疗后的肺部影像学得到了改善。综上所述,对于SARS-CoV-2 RNA阳性时间延长的患者,恢复期血浆治疗可能有助于消除SARS-CoV-2病毒,并缩短部分患者的住院时间。

针对新冠病毒蛋白酶抑制剂抗病毒活性分析

张磊砢, 刘佳, 曹瑞源, 徐明月, 吴妍, 尚卫娟, 汪习, 张环宇, 姜夏铭, 孙源, 胡恒睿, 李玉凤, 邹罡, 张珉, 赵磊, 李微, 郭小家, 庄笑梅, 杨兴娄, 石正丽, 邓菲, 胡志红, 肖庚富, 王曼丽, 钟武

2020, 35(6): 776 doi: 10.1007/s12250-020-00288-1

收稿日期: 2020-08-04 录用日期: 2020-08-14 出版日期: 2020-09-10
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由一种新型冠状病毒引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的暴发对公众健康构成了极大的威胁。寻找安全、有效的抗病毒药物是治愈大量患者的迫切需求。病毒编码的蛋白酶被认为是潜在的药物靶点。人类免疫缺陷病毒蛋白酶抑制剂(lopinavir/ritonavir)已在世界卫生组织3月份发起的全球联合试验中得到推荐。然而,目前尚无实验证据支持或反对其临床应用。我们评价了洛比那韦/利托那韦与其它两种病毒蛋白酶抑制剂的体外抗病毒作用,并探讨了其可能的抑制机制。在4种受试化合物中,洛比那韦对新型冠状病毒感染的抑制效果最好。但药代动力学分析表明按照标准计量给药:400 mg/10 mg (2 tablets)每天两次,洛匹那韦/利托那韦体内难以达到有效浓度。我们研究表明洛匹那韦/利托那韦应该在临床上停止对新冠肺炎的治疗。然而,这四种抑制剂的构效关系分析为未来SARS-CoV-2病毒蛋白酶抑制剂的设计提供了进一步的信息。

SARS-CoV-2负压隔离病房重要风险点的鉴定识别及环境的污染监测

宋志刚, 陈燕玫, 吴凡, 徐琳, 王邦芳, 石磊, 陈骁, 代发辉, 佘佳磊, 陈建民, 霍姆斯爱德华C., 朱同玉, 张永振

2020, 35(6): 785 doi: 10.1007/s12250-020-00301-7

收稿日期: 2020-05-28 录用日期: 2020-08-31 出版日期: 2020-09-28
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新型冠状病毒是2020年全球新型肺炎大流行的病原体,负压病房(AIIRs)内医护人员的职业暴露是院内感染的高危险因素。自2020年1月20日至3月10日,上海公共卫生临床中心AIIR病房累计收治334名新型冠状病毒患者。本研究中,我们收集了三个病区的负压病房、缓冲走廊以及清洁区的物体表面样本共计1544份,对环境污染情况进行了综合监测,以评估AIIR病房内新型冠状病毒传播的风险。结果表明,新型冠状病毒AIIR病房的定向气流和严格的卫生消毒使院内感染的风险较低。然而,在AIIRs的病房开门脚踏和卫生间洗手盆表面存在病毒RNA,病毒载量范围在55.00拷贝/毫升与3154.50拷贝/毫升之间。这些病原体可能是医护人员的鞋和手套接触物体表面造成的。医护人员通过使用一次性鞋套,同时采取严格环境和个人卫生消毒措施,能够有效降低医护人员感染风险。利用现行的院内感染控制措施,上海市公共卫生临床中心在AIIR病房工作的290名医护人员没有出现院内感染。本研究为收治新型冠状肺炎患者的医疗机构提供了院内感染控制的可行方案。

SARS-CoV-2长期阳性的新型冠状病毒肺炎病人:宿主免疫,病毒毒力和传染性

王星宇, 黄坤, 蒋海泥, 花丽娟, 余维巍, 丁丹, 王珂, 李小攀, 邹忠, 金梅林, 许淑云

2020, 35(6): 793 doi: 10.1007/s12250-020-00308-0

收稿日期: 2020-08-13 录用日期: 2020-09-10 出版日期: 2020-11-06
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新冠肺炎病人的中位病毒清除时间为初始症状出现后20天。然而,我们观察到部分新冠病人在初始症状出现后50天后其新冠核酸仍为阳性。本研究旨在探究该部分病人病毒延迟清除的原因和感染情况。本研究搜集了22例新冠核酸长阳病人的人口学和临床资料。研究对象的中位年龄为59.83±12.94岁。所有病人在新冠感染初始症状出现后53至112天内均临床治愈。其外周血淋巴细胞计数正常。分泌伽马干扰素的CD4+和CD8+细胞占比正常,分别为24.68±9.60%和66.41±14.87%。然而分泌伽马干扰素的NK细胞降低(58.03±11.78%)。所有病人均可检测到IgG,且与中和抗体活性呈正相关(中和抗体滴度=157.2,P=0.05)。此外,所有新冠病毒RT-PCR阳性病人均不能分离出活病毒,且对转染的Vero E6细胞无细胞毒性。宏基因组学测序显示在S蛋白编码区域仅有三个同义变异。本研究结论为:降低的分泌伽马干扰素的NK细胞和宿主体内较低的中和抗体可能造成其新冠核酸长期阳性。此外,核酸长阳的新冠病人病毒载量低下且病毒致病性较弱。

新型冠状病毒感染后有症状与无症状患儿的临床特点和流行病学特征比较

蔡洁皓, 王相诗, 赵隽, 葛艳玲, 徐锦, 田鹤, 常海岭, 夏爱梅, 王佳丽, 张进强, 魏仲秋, 李晶晶, 王楚宁, 王建设, 朱启鎔, 翟晓文, 曾玫

2020, 35(6): 803 doi: 10.1007/s12250-020-00312-4

收稿日期: 2020-07-19 录用日期: 2020-10-11 出版日期: 2020-11-04
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目前新型冠状病毒疫情在全球持续蔓延,儿童病例比重日渐增多,但关于儿童的新型冠状病毒特点以及儿童感染和成人的异同研究相对较少。本研究通过对2020年1月19日至4月30日期间上海市收治的49例儿童新冠患儿的临床流行病学研究,总结了新冠病毒感染后患儿的临床特点,并通过和无症状患儿实验室指标、排毒特点以及流行病学特征比较,研究儿童新冠感染的特征。通过对纳入49例确诊感染SARS-CoV-2的患儿发现,平均年龄为11.5±5.12岁,其中本土感染病例11例(22.4%),输入性感染病例38例(77.6%)。9例(81.8%)本土感染病例和12例(31.6%)输入性病例有明确的流行病学接触。有症状者28例(57.1%),无症状者21例(42.9%)。无危重症病例。无症状感染患儿的呼吸道标本排毒时间为14.1±6.4天,有症状患儿为14.8±8.4天(P>0.05)。45例(91.8%)患者在粪便中检测到新冠病毒。无症状患儿粪便标本排毒时间为28.1±13.3天,有症状患儿粪便排毒平均时间为30.8±18.6天,具有统计学差异(P<0.05)。年龄越小,粪便标本排毒时间越长。43例(87.8%)患者在确诊感染后1-3周内血清SARS-CoV-2抗体呈阳性。本研究发现,无症状的SARS-CoV-2感染可能在COVID-19大流行波期间社区儿童中较为常见。无症状病例和有症状病例的病毒传播模式相似。无症状患儿病情隐匿,但在新冠病毒的流行和传播中扮演重要角色,对新冠病毒的防治构成较为严重的挑战,需要重视。

基于纵向实验室检查结果预测COVID-19患者康复的预后模型

田肃岩, 朱学彤, 孙雪娟, 王金梅, 周琪, 王驰, 陈莉, 李善姬, 许建成

2020, 35(6): 811 doi: 10.1007/s12250-020-00317-z

收稿日期: 2020-06-01 录用日期: 2020-10-09 出版日期: 2020-11-10
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实验室数据随时间的变化模式可能为COVID-19的整个病程提供有益的线索。本研究旨在评估COVID-19患者主要实验室检查的纵向变化模式,并通过研究实验室检查结果与患者预后之间的关联确定独立预后因素。此项多中心研究纳入了2020年1月21日至2020年3月5日在中国吉林省治疗的56例COVID-19患者。实验室检查结果,流行病学特征和人口统计学数据均来自电子病历。在整个疾病过程中,嗜酸性粒细胞和二氧化碳结合力的平均值持续显著增加,而心肌肌钙蛋白I的平均值和平均血小板体积则呈现显著的下降。淋巴细胞的平均值在最初5天接近参考区间的下限,然后缓慢上升。血小板比容的平均值在第7天达到峰值后缓慢下降。平均红细胞体积和血清钠的平均值分别从第8天和第15天呈上升趋势。最终模型以年龄,性别,乳酸脱氢酶,血小板和球蛋白为预测因素,来预测COVID-19患者康复的时限。此模型在吉林省另一地区的24例COVID-19患者中得到了验证。根据实验室检查的时间变化轨迹,COVID-19患者的风险分层和管理可以得到改善。

不同疾病严重程度的COVID-19患者急性和恢复期的病毒和抗体动力学

张小勇, 卢素文, 李晖, 王奕, 卢振, 刘智泓, 赖钦涛, 纪雅丽, 黄璇, 李咏茵, 孙剑, 吴英松, 徐晓宁, 侯金林

2020, 35(6): 820 doi: 10.1007/s12250-020-00329-9

收稿日期: 2020-09-01 录用日期: 2020-11-23 出版日期: 2020-12-22
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新型冠状病毒 (SARS-CoV-2) 的全球大流行已严重威胁人类健康和经济。目前,关于新型冠状病毒肺炎 (COVID-19) 患者病毒脱落和血清抗体应答的长期数据仍然有限。在此,我们报道了中国湖北省洪湖市人民医院收治的不同疾病严重程度的COVID-19患者的临床特征、病毒RNA载量和急性期与恢复期的抗体动力学。总的来说,5.36%(6/112)的患者表现出咽拭子延长的病毒RNA脱落(> 45天)。重度组病毒载量峰值高于轻度组(中位阈值为36.4 vs 31.5;P = 0.002)。大多数患者的IgM抗体在症状出现后约4-6周消失,而IgG水平在症状出现后可持续超过194天,与急性期相比,大多数患者针对核衣壳蛋白(NP)的抗体滴度半年后降低了46%。我们对比了18名RT-qPCR确诊的无症状感染者及其密接接触的17名有症状患者的病毒和抗体动力学。在无症状个体中观察到IgG血清转化延迟和IgM血清低阳性率。这些数据表明,SARS-CoV-2感染患者的病毒载量越高,抗体反应越强,与病情越严重有关,且抗体在康复患者体内持续存在超过6个月,因此疫苗也许可以对SARS-CoV-2感染提供保护。
Letter

咽拭子样本混合应用SARS-CoV-2筛查的可行性研究

韩阳, 杨庆雨, 刘颖, 舒婷, 岳莉, 肖婷, 曾琴, 吴莹, 周溪, 张定宇

2020, 35(6): 830 doi: 10.1007/s12250-020-00254-x

收稿日期: 2020-05-12 录用日期: 2020-06-03 出版日期: 2020-07-08
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目前,全球都迫切需要在大规模人群中对COVID-19进行充分筛查和检测。然而,病毒核酸检测的能力在很大程度上受到仪器、试剂盒和人员数量的限制。因此,为了提高qRT-PCR检测核酸的效率,我们研究了将多个咽喉拭子样本混合的策略,使qRT-PCR反应能够检测到更多的对象。我们的结果表明,在少于4名受试者中混合喉拭子样本可以进行COVID-19核酸检测。这一策略可能有助于降低COVID-19核酸筛查的成本,提高筛查效率,在当前COVID-19大流行形势下显示较好的应用前景。

Patterns of Gustatory Recovery in Patients Affected by the COVID-19 Outbreak

2020, 35(6): 833 doi: 10.1007/s12250-020-00272-9

收稿日期: 2020-06-28 录用日期: 2020-07-15 出版日期: 2020-08-03
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Coronavirus disease 2019 (COVID-19) is a viral infection caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). From March 2020, several studies indicate that many subjects affected by mild-to-moderate COVID-19 presented olfactory/gustatory dysfunction (OD/GD) that appeared strongly correlated between them but not with the other symptoms suggestive of upper airway infectionIn order to evaluate patterns of gustatoy recovery, data from patients with confirmed COVID-19 were collected prospectively from 4 University Hospitals. At this relatively early point in the pandemic, the authors considered that subjective patterns of recovery of olfactory disfunction in COVID-19 patients are valuable for our patients, for hypothesis generation and treatment development.

新型冠状病毒无症状感染者T细胞应答的跟踪观察

杨菁毅, 张娥娟, 钟茂华, 杨庆雨, 洪可, 舒婷, 周谛晗, 项杰, 夏剑波, 周溪, 张定宇, 黄朝林, 尚游, 鄢慧民

2020, 35(6): 838 doi: 10.1007/s12250-020-00277-4

收稿日期: 2020-06-28 录用日期: 2020-07-24 出版日期: 2020-08-21
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自COVID-19疫情发生以来,不断有无症状感染者的报道,但此类感染人群的病毒学和免疫学研究十分有限。我们对武汉市一例境外输入病例进行了连续跟踪观察和研究,重点对其T细胞的活化和功能进行了较为详细的测定和分析。我们的研究发现,该例患者属于新型冠状病毒(SARS-CoV-2)无症状感染者,其外周血T细胞的数量正常,经历了完整的病毒感染后T细胞活化和分化过程。但在感染早期,T细胞活化和细胞因子分泌能力受到显著抑制,Th1和Tc1细胞亚群随着病毒清除逐渐部分恢复功能,但Th17细胞活化和功能持续低下。伴随T细胞的功能抑制,Treg细胞及活化的Treg(aTreg)细胞亚群出现数量或功能上的提升。这些研究结果显示, SARS-CoV-2感染在无症状感染者中造成了免疫系统活化和功能的紊乱,这可能与无症状感染者中特殊的病毒学过程和病理学过程有关。

乙肝患者合并严重急性呼吸综合征冠状病毒-2 (SARS-CoV-2)感染的临床特征

陈小平, 姜群群, 马智勇, 凌佳馨, 胡文佳, 曹倩, 莫平征, 姚磊, 杨蓉蓉, 高世成, 桂希恩, 侯炜, 熊勇, 李金林, 张永喜

2020, 35(6): 842 doi: 10.1007/s12250-020-00276-5

收稿日期: 2020-05-17 录用日期: 2020-07-13 出版日期: 2020-08-24
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SARS-CoV-2导致COVID-19 全球大流行,感染人数超过千万,夺走了几十万人的生命。在全球范围内,有大量的乙肝病人。SARS-CoV-2感染对乙肝病人影响仍不清楚。 本研究通过回顾性分析2020年1至3月收治于武汉大学中南医院的123名新冠病人(其中15名为乙肝病人)的临床资料,发现SARS-CoV-2 导致超过半数的非乙肝病的肝功能异常。7名乙肝病人在SARS-CoV-2感染后发展成重症。乙肝病人中的重症比例较高,2名 SARS-CoV-2感染的乙肝病人在住院期间死亡,分别死于严重的肝病和肠道出血。通过以上分析指出肝功能异常是SARS-CoV-2感染的一个重要指标。另外SARS-CoV-2感染似乎可以导致乙肝病人的病情加重。然后这一结论需要分析更多SARS-CoV-2感染的乙肝病人加以验证。

我国新冠疫情前后猫新冠病毒的血清学调查

邓均华, 刘玉秀, 孙春燕, 白晶晶, 孙杰, 郝丽颖, 李向东, 田克恭

2020, 35(6): 846 doi: 10.1007/s12250-020-00284-5

收稿日期: 2020-06-12 录用日期: 2020-08-03 出版日期: 2020-09-01
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随着猫自然感染SARS-CoV-2病例的报道和人工感染成功的证实,猫在SARS-CoV-2传播中的作用日益受到公众的关注。SARS-CoV-2通过患者感染猫的病例已有报道,但感染SARS-CoV-2的猫是否会传染给人却尚不清楚。因此,对新冠疫情前后猫血清中SARS-CoV-2抗体的调查可以回答上述问题并提供有价值的数据。本研究在SARS-CoV-2爆发前和爆发期间采集了1053份猫血清样本,用于检测SARS-CoV-2特异性抗体,检测结果均为阴性。上述结果缓解了公众在疫情期间对猫是否会传播新冠病毒的担忧与恐慌。

一项对两例合并感染SARS-CoV-2和人体免疫缺陷病毒的病例进行的研究

张蓉, 陈晓华, 黄钰清, 张祺, 程琰, 张楠, 张海波, 杨博, 刘芳, 刘映乐, 蓝柯

2020, 35(6): 849 doi: 10.1007/s12250-020-00280-9

收稿日期: 2020-05-07 录用日期: 2020-08-13 出版日期: 2020-09-07
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2019冠状病毒病(COVID-19)患者免疫系统普遍存在一定程度的损伤,可能会导致患者病情加重甚至死亡。在本研究中,我们报告了2例被诊断为艾滋病毒感染的COVID-19患者的前期病程。目的是探讨COVID-19在HIV患者中的临床表现及治疗建议。

Different Laboratory Abnormalities in COVID-19 Patients with Hypertension or Diabetes

2020, 35(6): 853 doi: 10.1007/s12250-020-00296-1

收稿日期: 2020-07-09 录用日期: 2020-08-31 出版日期: 2020-09-30
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We reported recently that hypertension is a risk factor for severe cases of COVID-19, independent of age and other variables (Liu et al. 2020a). An important question is why patients with hypertension and diabetes yield poorer clinical outcomes than those without. Human pathogenic coronavirus SARS-CoV-2 utilizes angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) as a receptor for viral cell entry. Since the levels of ACE2 are substantially increased in patients with hypertension or diabetes, who are treated with ACE inhibitors (ACEIs) and angiotensin Ⅱ type-Ⅰ receptor blockers (ARBs) (Ferrario et al. 2005), Fang and colleagues hypothesized that ACE2-stimulating drugs could potentially increase the risk of developing severe COVID-19 (Fang et al. 2020). This was not supported by a recent study led by Dr. Reynolds (Reynolds et al. 2020), whose analysis showed no positive association for ACEIs or ARBs for either the risk of SARS-CoV-2 infection or severe illness (Reynolds et al. 2020). What else might explain the poorer clinical outcomes of COVID-19 patients with hypertension or diabetes?To explore this question, we re-analysed the same cohort of 99 COVID-19 patients discharged from the general wards of Renmin Hospital of Wuhan University between 5 February 2020 and 14 March 2020 (Ethics approval No: WDRY2020-K124) (Liu et al. 2020a, b).

糖基结合蛋白griffithsin和广谱冠状病毒入侵抑制剂EK1的联合应用能够协同抑制SARS-CoV-2感染

蔡艳星, 徐巍, 谷陈建, 蔡霞, 瞿涤, 陆路, 谢幼华, 姜世勃

2020, 35(6): 857 doi: 10.1007/s12250-020-00305-3

收稿日期: 2020-08-12 录用日期: 2020-09-10 出版日期: 2020-10-14
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由新型冠状病毒SARS-CoV-2引起的COVID-19大流行给人类健康和全球经济造成了巨大的威胁,因此急需开发能够有效预防和治疗COVID-19的药物。Griffithsin是一种从红藻Griffithsia中提取的一种糖基结合蛋白。该蛋白最早被用于预防HIV的性传播,具有安全性高等优点。本文通过SARS-CoV-2假病毒感染实验、SARS-CoV-2活病毒感染实验和SARS-CoV-2 S蛋白介导的细胞融合实验发现griffithsin能够在体外抑制SARS-CoV-2感染。Griffithsin通过结合S蛋白的糖基来发挥抑制SARS-CoV-2感染的作用。联合应用griffithsin和EK1能够协同抑制SARS-CoV-2感染。这些结果提示griffithsin有成为预防或治疗COVID-19药物的潜能。

武汉新型冠状病毒肺炎儿童的流行病学、临床和血清学特征:一项单中心、回顾性研究

罗丹, 夏治, 李恒, 涂丹娜, 王霆, 张玮, 彭璐, 易文富, 张赛, 舒俊华, 许慧, 李勇, 石步云, 黄成姣, 汤文, 肖书娜, 舒小兰, 刘艳, 张源, 郭珊, 余志, 王宝香, 高源, 胡勤学, 王汉中, 宋晓晖, 梅红, 周小勤, 郑振华

2020, 35(6): 861 doi: 10.1007/s12250-020-00333-z

收稿日期: 2020-08-26 录用日期: 2020-11-30 出版日期: 2020-12-22
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新型冠状病毒(SARS-CoV-2)导致的2019冠状病毒病(COVID-19)正处于全球大流行期,COVID-19儿童的数据有限,特别是血清学研究方面。本研究回顾性分析了疫情期间武汉地区34例COVID-19患儿的流行病学、临床特征和血清学特征。结合患儿的流行病学和临床特征,先采用咽拭子SARS-CoV-2核酸检测确诊了14例COVID-19患儿,再采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测特异性抗体确定了另20例COVID-19患儿。34例患儿的主要年龄分布为0-1岁(23.5%)、1-2岁(23.5%)、6-10岁(29.4%),男童占70.6%,55.9%的患儿有家族性聚集性发病的特点,75%的COVID-19婴儿为母乳喂养儿。患儿的常见症状为发热(70.6%)、咳嗽(82.4%);淋巴细胞减少仅发生在11.8%的患儿中;CT显示右肺和双肺斑片状影分别占70.6%和47.1%;特异性IgM和IgG分别于发病后1-9天和2-22天可检测到,不同年龄、性别患儿特异性IgM、IgG水平差异无统计学意义(P > 0.05)。因此,加强婴幼儿和学龄儿童家庭保护性隔离至关重要;淋巴细胞减少不应列为儿童COVID-19的常规诊断指标;COVID-19患儿易合并支原体感染;对于有发热、咳嗽及CT提示肺部斑片状影的患儿,发病后1~3周内特异性抗体检测对诊断COVID-19具有重要价值,特别是在SARS-CoV-2核酸呈阴性的情况下;COVID-19的母婴传播需要深入研究。
Perspective

中国现代公共卫生体系的建立及对新现传染病防控的展望——纪念鼠疫斗士伍连德博士诞辰140周年

张庆猛, NiazAhmed, 高福, 张凤民

2020, 35(6): 868 doi: 10.1007/s12250-020-00269-4

收稿日期: 2020-01-30 录用日期: 2020-06-28 出版日期: 2020-08-03
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在伍连德博士(1879-1960)诞辰140周年之际,我们较全面地回顾了他的著作和学术记录(主要集中在1910 - 1936期间),介绍了他在鼠疫等传染病防治和科学研究方面的学术成就和突出贡献,而这一时期正值中国现代公共卫生体系建立的初始阶段。此外,本研究还讨论了如当前的COVID-19大流行等新发传染病的防控经验,并对中国和全球现代公共卫生体系的完善和发展提出了展望。

Coping with COVID-19 in Sub-Saharan Africa: What Might the Future Hold?

2020, 35(6): 875 doi: 10.1007/s12250-020-00279-2

收稿日期: 2020-06-04 录用日期: 2020-07-24 出版日期: 2020-09-01
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Sub-Saharan countries are sadly linked with similar poor indicators, such as high poverty and mortality rates, the burden of disease, fragile health systems and poorly developed infrastructure. Along with the rest of the world, Sub-Saharan countries are facing this new coronavirus outbreak. Nevertheless, chaotic predictions of a particularly destructive epidemic in Africa do not seem to be borne out, at least for the time being. But uncertainties remain, such as how the virus is spreading in countries with low incomes, informal economies, high HIV/tuberculosis prevalence, extremely low median age, or warm/dry climates and for which containments are almost impossible to enforce? Not even 8 months after the first reported case in China, parts of the world are already showing post-lockdown twilight measures. Yet, the war is certainly far from over, because the virus is gaining ground in the sub-Saharan zone. This viewpoint attempts to describe the COVID-19 crisis in a sub-Saharan perspective, in particular in the Republic of Chad, from both, distant perception and by living it on a daily basis.
Correction

Correction to: Discrimination of False Negative Results in RT-PCR Detection of SARS-CoV-2 RNAs in Clinical Specimens by Using an Internal Reference

2020, 35(6): 885 doi: 10.1007/s12250-020-00293-4

出版日期: 2020-09-21
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Reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) is an essential method for specific diagnosis of SARS-CoV-2 infection. Unfortunately, false negative test results are often reported. In this study, we attempted to determine the principal causes leading to false negative results of RT-PCR detection of SARS-CoV-2 RNAs in respiratory tract specimens. Multiple sputum and throat swab specimens from 161 confirmed COVID-19 patients were tested with a commercial fluorescent RT-PCR kit targeting the ORF1ab and N regions of SARS-CoV-2 genome. The RNA level of a cellular housekeeping gene ribonuclease P/MRP subunit p30 (RPP30) in these specimens was also assessed by RT-PCR. Data for a total of 1052 samples were retrospectively re-analyzed and a strong association between positive results in SARS-CoV-2 RNA tests and high level of RPP30 RNA in respiratory tract specimens was revealed. By using the ROC-AUC analysis, we identified Ct cutoff values for RPP30 RT-PCR which predicted false negative results for SARS-CoV-2 RT-PCR with high sensitivity (95.03%–95.26%) and specificity (83.72%–98.55%) for respective combination of specimen type and amplification reaction. Using these Ct cutoff values, false negative results could be reliably identified. Therefore, the presence of cellular materials, likely infected host cells, are essential for correct SARS-CoV-2 RNA detection by RT-PCR in patient specimens. RPP30 could serve as an indicator for cellular content, or a surrogate indicator for specimen quality. In addition, our results demonstrated that false negativity accounted for a vast majority of contradicting results in SARS-CoV-2 RNA test by RT-PCR.

Correction to: Dynamic Changes of Antibodies to SARS-CoV-2 in COVID-19 Patients at Early Stage of Outbreak

2020, 35(6): 887 doi: 10.1007/s12250-020-00318-y

出版日期: 2020-11-24
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The coronavirus disease 2019 (COVID-19), caused by SARS-CoV-2, has spread around the world with high mortality. To diagnose promptly and accurately is the vital step to effectively control its pandemic. Dynamic characteristics of SARS-CoV-2-specific antibodies which are important for diagnosis of infection have not been fully demonstrated. In this retrospective, single-center, observational study, we enrolled the initial 131 confirmed cases of COVID-19 at Jin-Yin-Tan Hospital who had at least one-time antibody tested during their hospitalization. The dynamic changes of IgM and IgG antibodies to SARS-CoV-2 nucleocapsid protein in 226 serum samples were detected by ELISA. The sensitivities of IgM and IgG ELISA detection were analyzed. Result showed that the sensitivity of the IgG ELISA detection (92.5%) was significantly higher than that of the IgM (70.8%) (P < 0.001). The meantimes of seroconversion for IgM and IgG were 6 days and 3 days, respectively. The IgM and IgG antibody levels peaked at around 18 days and 23 days, and then IgM fell to below the baseline level at about day 36, whereas IgG maintained at a relatively high level. In conclusion, antibodies should be detected to aid in diagnosis of COVID-19 infection. IgG could be a sensitive indicator for retrospective diagnosis and contact tracing, while IgM could be an indicator of early infection.

35卷第6期 (2020年12月)

ISSN 1674-0769

EISSN 1995-820X

CN 42-1760/Q

主编: 石正丽

影响因子: 3.242*

*源于2019年JCR

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