2025年40卷1期
Seasonal influenza A viruses (IAVs) and influenza B viruses (IBVs) are common causes of human respiratory diseases. Vaccines are the most effective means of preventing influenza infections. However, the protective effects of existing IBV vaccines against mutated strains have not been comprehensively evaluated. In this issue, Zhang et al. systematically analyzed the antigenicity of hemagglutinin protein from circulating B/Victoria and B/Yamagata IBV strains. They found that the recommended IBV vaccine strains showed strong neutralization activity against the epidemic virus strains within the same year. Analyses on mutation sites indicated that key amino acid substitutions, such as R141G, D197N, and R203K, could significantly affect the antigenicity of B/Victoria vaccine strains, highlighting the need for vigilant monitoring. The cover image shows the game between the evolution of influenza virus and the human immune system (Kindly designed and provided by Prof. Weijin Huang). See page 80–91 for details.
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人类和动物轮状病毒疫苗最新研究进展：探索新前沿
2025, 40(1): 1 doi: 10.1016/j.virs.2024.12.001
收稿日期: 2024-09-05
录用日期: 2024-12-10
轮状病毒在全球范围流行，导致幼儿和动物出现严重的胃肠炎和脱水，尤其在低收入和中等收入国家流行情况尤为严重，造成了较高的发病率和死亡率。在过去十年中，轮状病毒疫苗的研发和应用取得了显著进展，这不仅在人类健康领域显著减轻该病的全球负担，这些疫苗对畜牧动物（如小牛和仔猪）也具有重要的保护作用，因为该病毒导致幼龄动物的感染和死亡，给养殖业造成了重大的经济损失。本综述文章通过整合最新研究与实践证据，深入探讨了轮状病毒疫苗技术的现状及其在全球的推广应用，并着重分析了轮状病毒疫苗在兽医学领域的应用及其在控制人畜共患病传播和保障食品安全方面的重要性。
基因流视角下人间H10N5禽流感病毒的起源与演化研究
2025, 40(1): 15 doi: 10.1016/j.virs.2024.12.002
收稿日期: 2024-09-03
录用日期: 2024-12-16
2024年1月30日，中国监测到首例人H10N5禽流感病例。在此之前，已报告了人感染H10N7和H10N8亚型禽流感病例。因此，当前有必要重新审视H10和N5亚型禽流感病毒（avian influenza viruses,AIVs）的演化及未来流行病学趋势。本研究中，我们分析了首个从人分离的H10N5 AIV（A/Zhejiang/ZJU01/2023）的基因重配特征，以及过去十年来野生鸟类来源的H10和N5亚型AIV的演化动态。我们发现，该人源H10N5 AIV毒株呈现低致病性特征。A/bean_goose/Korea/KNU-10/2022(H10N7)和A/mallard/Novosibirsk_region/962k/2018(H12N5)被鉴定为潜在的重配亲本。该病毒自2022年起就已存在，在孟加拉国有多次分离记录。系统发育分析显示，中国的H10Ny和HxN5 AIV根据东亚-澳大利亚（东部）和中亚-印度（西部）野鸟迁徙带的不同而聚类。H10Ny和HxN5 AIV重配株可能通过意外溢出感染人类，尤其是东北亚候鸟迁徙路线沿线，此处有可能正形成有别于欧洲、美洲及中国长三角、珠三角地区的另一个禽流感病毒进化、变异与重配中心，需加强监测以保障公共卫生安全。
A low pathogenic avian influenza A/Mallard/South Korea/KNU2019-34/2019 (H1N1) virus has the potential to increase the mammalian pathogenicity
2025, 40(1): 24 doi: 10.1016/j.virs.2024.12.005
收稿日期: 2024-07-11
录用日期: 2024-12-25
Influenza, a highly contagious respiratory infectious disease caused by an influenza virus, is a threat to public health worldwide. Avian influenza viruses (AIVs) have the potential to cause the next pandemic by crossing the species barrier through mutation of viral genome. Here, we investigated the pathogenicity of AIVs obtained from South Korea and Mongolia during 2018–2019 by measuring viral titers in the lungs and extrapulmonary organs of mouse models. In addition, we assessed the pathogenicity of AIVs in ferret models. Moreover, we compared the ability of viruses to replicate in mammalian cells, as well as the receptor-binding preferences of AIV isolates. Genetic analyses were finally performed to identify the genetic relationships and amino acid substitutions between viral proteins during mammalian adaptation. Of the 24 AIV isolates tested, A/Mallard/South Korea/KNU2019-34/2019 (KNU19-34; H1N1) caused severe bodyweight loss and high mortality in mice. The virus replicated in the lungs, kidneys, and heart. Importantly, KNU19-34-infected ferrets showed high viral loads in both nasal washes and lungs. KNU19-34 replicated rapidly in A549 and bound preferentially to human like α2,6-linked sialic acids rather than to avian-like α2,3-linked sialic acids, similar to the pandemic A/California/04/2009 (H1N1) strain. Gene segments of KNU19-34 were distributed in Egypt and Asia lineages from 2015 to 2018, and the virus had several amino acid substitutions compared to H1N1 AIV isolates that were non-pathogenic in mice. Collectively, the data suggest that KNU19-34 has zoonotic potential and the possibility of new mutations responsible for mammalian adaptation.
PB2 627V和HA 217位点协同影响H9N2亚型禽流感病毒对小鼠的致死率
2025, 40(1): 35 doi: 10.1016/j.virs.2024.12.003
收稿日期: 2024-09-15
录用日期: 2024-12-16
H9N2亚型禽流感病毒（AIV）在中国境内持续传播和进化，对家禽业构成重大威胁。本研究在2018年至2019年期间收集了华东地区的436个样本和拭子，从中分离和纯化了31株H9N2亚型流感病毒。我们发现31个分离株的HA和NA基因属于Y280分支，而PB2和M基因与G1分支相关，其余基因与F/98分支一致。尽管存在这种一致性，但抗原图谱显示2018年和2019年毒株之间的抗原性存在差异。早期疫苗株对这些分离株表现出较低的血清反应性。值得注意的是，CK/SH/49/19分离株在小鼠中表现出致死性，其特征是PB2 E627V突变和HA 217位置氨基酸的缺失。机制研究表明，携带PB2 627V和HA 217M突变的流感病毒CK/SH/49/19在体外实验中表现出增强的复制能力，这归因于PB2 627V突变提高了聚合酶活性。此外，HA 217位点氨基酸的缺失阻碍了病毒吸附和内化过程，导致其活化pH值降低，并阻碍了病毒的出芽过程。关键体内实验表明，CK/SH/49/19(PB2 627V,HA 217Δ)引发了更强的干扰素反应和干扰素刺激基因的激活。本研究为H9N2亚型禽流感的科学防控策略提供了理论基础。
2022年6月-2023年9月中国武汉急性呼吸道感染住院儿童中腺病毒分离株基因型及临床表现的比较分析
2025, 40(1): 50 doi: 10.1016/j.virs.2024.12.004
收稿日期: 2024-07-11
录用日期: 2024-12-17
急性呼吸道感染（ARTIs）是导致全球儿童患病和死亡的主要原因之一。人腺病毒（HAdV）感染占儿童急性呼吸道感染的5%及以上。在中国武汉，有关HAdV在针对SARS-CoV-2的非药物性干预措施解除前后的流行型别以及型别与临床表现之间的关系仍不清楚。本研究中，从2022年至2023年ARTI住院儿童HAdV核酸检测阳性的咽拭子标本中分离获得101株HAdV。其中，2022年的66株和2023年的23株根据hexon、penton base和fiber基因序列特征成功进行了基因分型和进化分析。鉴定得到6个基因型，包括B3,C1,C2,C5,C104和C108。其中2022年的流行型别主要为HAdV-B3型（占比84.85%），而2023年的流行型别主要为HAdV-C型(占比86.96%)，包括C1，C2，C108和C104。从分子进化分析上来看，这些流行株的型别接近于近年来日本、中国和美国等地的流行株。临床特征比较显示，感染B3、C1、C2、C5、C104或C108的儿科患者临床表现相似，主要症状为发烧和咳嗽，但IL-10的水平不同。综上，2022年6月至2023年9月，武汉地区流行的HAdV有B3,C1,C2,C108,C5和C104型。HAdV的流行规律从2022年以B型为主，转变为2023年以C型为主。
Zika virus infections and associated risk factors among pregnant women in Gombe, Nigeria
2025, 40(1): 61 doi: 10.1016/j.virs.2024.12.008
收稿日期: 2024-07-25
录用日期: 2024-12-27
In-utero exposure to Zika virus (ZIKV) could lead to miscarriage, preterm birth and congenital Zika syndrome. This study aimed at estimating the burden of ZIKV and Dengue virus (DENV) infections among pregnant women in Bojude, Nigeria. A total of 200 blood samples were collected from pregnant women between February and April 2022. Using the updated CDC guidelines for the diagnosis of ZIKV infections, including ELISA and microneutralization test (MNT), we found that 16.5% of participants were positive for ZIKV IgM, 10% were positive for IgG, and 23% had nAb in their serum. Among the 46 ZIKV nAb-positive women, 52.2% and 10.9% were recent and previous ZIKV infections, respectively, while 6.5% had previous DENV infections. Although no recent DENV infection was detected, recent and previous ZIKV/DENV co-infections were 13.0% and 17.4%, respectively. Two participants had recent secondary ZIKV infections, while 39.1% had prolonged lifelong immunity. Recent ZIKV infection rates were significantly higher among sexually active females aged 20–29 years than other age groups, with the highest risk observed in the first trimester of pregnancy. In addition, the grand-multiparous women are at higher risk of ZIKV infections than other categories. Monotypic recent, secondary and past ZIKV infections, as well as DENV and ZIKV co-infections, were detected in both the asymptomatic and symptomatic pregnant women. These findings highlight that ZIKV infection is prevalent among pregnant women in Nigeria and underscore the associated risk factors, providing evidence-based information on the burden of ZIKV infections in DENV-endemic region.
橐吾中一种新的香石竹潜隐病毒的发现与鉴定
2025, 40(1): 71 doi: 10.1016/j.virs.2024.11.003
收稿日期: 2024-05-09
录用日期: 2024-11-05
橐吾是一种重要的药用和观赏植物，然而，侵染橐吾植物的病毒迄今还是未知的。在本研究中，我们通过RNA大规模测序技术，在表现出褪绿和黄化环斑症状的橐吾植物中鉴定到一种暂命名为橐吾香石竹潜隐病毒(ligularia jaluensis carlavirus,LJCV)的香石竹潜隐病毒属新病毒和已知的鸢尾重型花叶病毒(iris severe mosaic virus,RSMV)。LJCV基因组是一条长度为8497个核苷酸[不包括poly (a)尾]的正单链RNA，其包含六个开放阅读框。基于病毒全基因组序列和RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)氨基酸序列的系统发育进化树分析表明，LJCV与香石竹潜隐病毒属病毒位于同一进化分支。LJCV的ORF1编码的RdRp蛋白与8种相关的香石竹潜隐病毒属病毒的RdRp蛋白具有45.38%–67.41%氨基酸同源性。ORFs 2-4编码的蛋白称为三基因框蛋白(TGB)，即TGBp1-3。亚细胞定位结果显示，TGBp1和TGBp3定位于内质网，TGBp2定位于胞间连丝。我们通过运动缺陷突变体PVXΔp25-GFP回补实验进一步确定了TGBp2为病毒运动蛋白。此外，ORF6编码的富含半胱氨酸蛋白(CRP)定位于叶绿体，且其在异源PVX表达系统中诱导产生严重的病毒症状而被鉴定为病毒致病因子。另外，我们成功构建了LJCV的感染性cDNA克隆，并发现LJCV可以经机械摩擦接种或侵染性克隆的农杆菌接种感染本氏烟植物。这些研究发现增强了我们对香石竹潜隐病毒属病毒的特征及其宿主范围的理解，同时了解了侵染橐吾植物的病毒。
乙型流感病毒（Influenza B viruses，IBV）主要感染人类，是导致人类呼吸道感染的常见病因。为了系统分析乙型流感病毒血凝素（Hemagglutinin，HA）蛋白的抗原性，本研究从全球流感数据共享倡议（Global Initiative of Sharing All Influenza Data ，GISAID）中筛选出31株B/Victoria和19株B/Yamagata的代表株，并基于水泡性口炎病毒系统构建假病毒。本研究对豚鼠免疫了三针IBV疫苗株疫苗（一针DNA疫苗和两针假病毒疫苗），并检测了针对不同代表株假病毒的中和抗体水平。通过比较不同疫苗株之间的差异，本研究以疫苗株BV-21为基础，构建了几种含有不同突变的假病毒。疫苗株免疫血清对当年流行的代表株有较好的中和水平，中和滴度在370至840之间，而对往年流行代表株的中和水平随着年份的推移下降1-10倍。B/Victoria和B/Yamagata的高频流行株不仅能够诱导出高中和滴度抗体，而且对不同年份的代表株也有广谱中和作用，中和滴度范围为1000-7200。同时，我们发现R141G、D197N和R203K影响了IBV的抗原性。在这项研究中，我们基于假病毒新系统来监测高频流行株和世界卫生组织推荐疫苗株的交叉中和能力。另外，我们还发现了三个严重影响B/Victoria疫苗株抗原性的突变位点。这些突变位点可以为将来选择和设计通用的IBV疫苗株提供一定的参考。
CRTC3限制SARS-CoV-2复制及受CREB拮抗
2025, 40(1): 92 doi: 10.1016/j.virs.2024.12.006
收稿日期: 2024-08-05
录用日期: 2024-12-26
人类冠状病毒，包括严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2），编码的RNA依赖的RNA聚合酶（RdRp）对病毒基因组复制和基因转录必不可少。我们课题组前期鉴定了SARS-CoV-2 RdRp催化亚基NSP12与一个宿主蛋白，环磷腺苷效应元件结合蛋白（CREB）调控转录共激活因子3（CRTC3）存在相互作用。该宿主蛋白属于CRTC家族，能够调控CREB介导的转录激活。目前，CRTC3在人类冠状病毒致病性中的作用尚不清楚。本研究结果显示CRTC3能够减弱SARS-CoV-2 RdRp聚合酶活性及病毒基因组复制，因而减少子代病毒的产生。此外，CRTC3与NSP12互作有助于其抑制RdRp聚合酶活性。进一步发现两个CRTC家族成员（CRTC1和CRTC2）对致死性人类冠状病毒，包括SARS-CoV-2和中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV），RdRp聚合酶活性的抑制效果，并受到CREB拮抗。综上，该研究表明CRTCs限制人类冠状病毒复制并受CREB拮抗，这不仅为人类冠状病毒复制调控提供了新的见解，也为发展抗人类冠状病毒干预手段提供了重要信息。
基于随机森林算法揭示改变H9N2禽流感病毒受体结合偏好的新位点
2025, 40(1): 109 doi: 10.1016/j.virs.2024.12.010
收稿日期: 2024-08-29
录用日期: 2024-12-29
禽流感病毒从禽型α-2,3受体向人型α-2,6受体的转变是引发大流行的关键因素。一些H9N2病毒显示出结合人型α-2,6受体的偏好，提示其可能对公共卫生构成威胁。然而，我们对其受体偏好转变的分子机制仍然了解有限。在本研究中，我们使用随机森林算法预测了HA蛋白中12个潜在关键氨基酸位点（N158D、N158S、A160N、A160D、A160T、T163I、T163V、V190T、V190A、D193N、D193G和N231D）与H9N2禽流感病毒（AIV）偏向结合α-2,6受体相关的。随后，这些位点通过受体结合实验进行了进一步验证。除V190T突变外，其他突变都跟预期一致，被证明偏好结合α-2,6受体。值得注意的是，A160T替换导致小鼠免疫反应基因显著上调，并提高了小鼠的死亡率。我们的研究结果为理解H9N2 AIV受体偏好的遗传基础提供了新的见解。
中国HIV/HBV合并感染成人5年抗逆转录病毒治疗后肝纤维化演变模式：一项使用无创APRI和Fib-4评分的纵向研究
2025, 40(1): 118 doi: 10.1016/j.virs.2024.12.009
收稿日期: 2024-06-13
录用日期: 2024-12-27
联合抗逆转录病毒疗法（ART）对人类免疫缺陷病毒（HIV）和慢性乙型肝炎病毒（HBV）共感染成人患者的肝纤维化模式的长期影响尚不清楚。因此，本研究旨在调查肝纤维化的轨迹，并确定基线变量与肝纤维化演变不同模式的关联。本研究共纳入333例HIV/HBV合并感染并接受长期ART的个体。在基线和年度访问期间收集人口统计学、临床和生化数据。基于纤维化-4 （Fib-4）和天冬氨酸转氨酶与血小板比值指数（APRI）评分的纵向数据，采用基于组的轨迹模型（GBTMs）检测肝纤维化演变模式。进行Logistic回归分析以确定肝纤维化演变的基线预测因子。所有参与者的年龄中位数为33岁。其中，89.5%的患者最初接受了含替诺福韦酯（tenofovir disproxil fumarate，TDF）的ART方案。GBTMs使用APRI或Fib-4评分确定了肝纤维化演变的两种不同模式。大多数个体（78.5%的APRI评分和75.3%的Fib-4评分;模式A）表现出稳定或低纤维化且无显著变化，而其余参与者表现出从高纤维化水平消退（APRI评分为21.5%，Fib-4评分为24.7%;模式B）。与B型参与者相比，A型参与者更年轻，基线时CD4+细胞计数较高，淋巴细胞计数较高，白细胞计数较高，血小板计数较低。对于具有不同程度初始肝纤维化的HIV/HBV合并感染患者，长期ART已显示出差异化的肝纤维化缓解模式。
扶正解毒汤抗冠状病毒的作用机制和物质基础
2025, 40(1): 125 doi: 10.1016/j.virs.2024.12.007
收稿日期: 2024-08-20
录用日期: 2024-12-26
传统中医药在防治新冠肺炎方面具有独特优势，扶正解毒汤在新冠肺炎的临床试验中显示出一定的有效性。为了探讨扶正解毒汤抗SARS-CoV-2的潜在作用机制和物质基础，我们测试了扶正解毒汤对多种SARS-CoV-2靶蛋白的抑制活性，并且对扶正解毒汤进行了代谢物全谱分析。结果显示，扶正解毒汤能够阻断SARS-CoV-2 S蛋白与受体ACE2的结合，并且对SARS-CoV-2 3CLpro的活性具有抑制作用。通过转录组分析发现，扶正解毒汤能够调节TNF和MAPK信号通路，抑制炎症反应，缓解“细胞因子风暴”。此外，在扶正解毒汤中共鉴定出298种化合物，其中咖啡酸和没食子酸辛酯是扶正解毒汤发挥抗新冠病毒作用的潜在治疗成分。我们对扶正解毒汤的广谱抗冠状病毒活性进行了测试，发现其对包括SADS-CoV、PEDV、SARS-CoV假病毒、MERS-CoV假病毒和多种SARS-CoV-2突变株假病毒均具有抑制作用，这可能归因于咖啡酸和辛基没食子酸辛酯的广谱抗冠状病毒活性。总之，本研究揭示了扶正解毒汤抗SARS-CoV-2的作用机制和物质基础，并首次发现扶正解毒汤的广谱抗冠状病毒活性，为扶正解毒汤的开发和应用提供了实证依据。
荆门蜱病毒在中国野猪中的地理分布和特征
2025, 40(1): 137 doi: 10.1016/j.virs.2024.12.011
收稿日期: 2024-10-22
录用日期: 2024-12-30
荆门蜱病毒（JMTV）是一种分节段单股正链RNA病毒，是一种新发现的可引起人类疾病的蜱传病毒，表明JMTV具有公共卫生意义。JMTV已被证实是拥有广泛的宿主范围。为了全面系统地了解JMTV的遗传多样性和宿主范围，本研究使用RT-qPCR对2018年至2023年间从中国26个省份收集的459头外表健康的野猪进行了JMTV检测。结果显示在26个省份中，有9个省份鉴定出JMTV RNA，平均感染率为5.45%（25/459），通过MTT分析获得了6个JMTV全基因组序列。系统发育分析表明，所有JMTV毒株可分为两个系统发育群，本研究中鉴定的JMTV与日本JMTV毒株而非中国JMTV毒株具有最密切的进化关系，表明JMTV可能具有复杂的进化历史。此外，JMTV病毒载量结果表明，JMTV广泛分布于各种组织中，并且所有阳性野猪均未出现临床症状，表明野猪很可能是JMTV潜在的储存宿主。我们的研究结果首次全面系统地阐明了JMTV在中国野猪中的流行情况，并表明JMTV作为一种自然疫源地病原体在中国广泛分布。
HCMV和SARS-CoV-2在晚期HIV患者肺组织中的不同细胞嗜性
2025, 40(1): 141 doi: 10.1016/j.virs.2025.01.001
收稿日期: 2024-09-19
录用日期: 2025-01-09
COVID-19大流行对HIV感染者带来了重大挑战。这一人群面临SARS-CoV-2及与其他病原体共同感染的风险，但这些共同感染的影响仍然缺乏深入研究。本报告呈现了一例HIV、SARS-CoV-2和人类巨细胞病毒（HCMV）共同感染的罕见病例。尽管SARS-CoV-2感染被成功抑制，患者最终还是因严重肺炎去世。尸检分析揭示了HCMV和SARS-CoV-2在肺部的不同感染模式，提示二者在疾病进展中可能存在协同作用。此案例突显了管理伴随感染的HIV患者的复杂性，并强调了对严重免疫抑制者进行HCMV监测的必要性。
基于受体结合域的沙贝冠状病毒mRNA候选疫苗的快速开发和评价
2025, 40(1): 144 doi: 10.1016/j.virs.2024.11.004
收稿日期: 2024-07-06
录用日期: 2024-11-08
迄今为止，新型冠状病毒仍然在持续流行和变异。此外，其他沙贝冠状病毒也存在溢出风险，对人类生命健康具有潜在威胁。因此，探索一种沙贝冠状病毒通用疫苗的快速制备方法，以有效应对不同病毒株感染的潜在风险具有重要意义。结合上述需求，本文开发了一种基于体外扩增技术的mRNA疫苗快速制备方法，可实现从不同沙贝冠状病毒核酸样本中直接扩增获得编码受体结合域（RBD）的线性DNA模板，在此基础上进一步完成mRNA原液制备及疫苗合成。相较于传统mRNA疫苗制备方法，上述方法可显著缩短mRNA疫苗制备周期。我们进一步通过实验证实，基于该方法制备的新冠病毒奥密克戎BA.4/5变异株mRNA疫苗两针免疫小鼠能够有效诱导高水平中和抗体，抗体效价与传统方法制备的疫苗所诱导的抗体水平无显著性差异。本研究为冠状病毒通用疫苗的设计和开发提供了参考。
40卷第2期 (2025年0月)
ISSN 1674-0769
EISSN 1995-820X
CN 42-1760/Q
主编: 肖庚富
影响因子: 4.3*
*源于2023年JCR
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